ต่อมา ปี พ.ศ. 2476 ยุบอำเภอจักรวรรดิไปรวมกับอำเภอสัมพันธวงศ์ ที่ซอยโยธา ถนนเจริญกรุง ส่วนอาคาร ที่ทำการอำเภอจักรวรรดิเดิม ได้มอบให้เป็นที่ทำการสถานีตำรวจนครบาลจักรวรรดิอีกหลังหนึ่ง ปี พ.ศ. 2499 กรมตำรวจเห็นว่าเรือนไม้ที่ทำการเดิมของ สถานีตำรวจนครบาลก่อสร้างมานานแล้ว มีสภาพ คับแคบและชำรุดทรุดโทรมไปตามสภาพการซ่อมแซมไม่คุ้มค่า จึงได้ย้ายมาตั้งที่ทำการชั่วคราว เลขที่ 324 ถนนทรงวาด 1 ซึ่งเป็นสถานีตำรวจดับเพลิงมาก่อน เมื่อจะรื้อถอนเรือนไม้เดิม เพื่อสร้างใหม่พร้อมแฟลตที่พัก ได้มีผู้โต้แย้งกรรมสิทธิ์ในที่ดินแปลงนี้
ทำไม่สามารถก่อสร้างได้ ข้าราชการตำรวจจึงดัดแปลงชั้นบนเป็นที่พัก ของข้าราชการตำรวจและครอบครัวต่อมาอีกระยะหนึ่ง เมื่อการแก้ไขปัญหาเรื่องกรรมสิทธิ์ที่ดินได้ยุติลง โดยผู้มีบทบาทสำคัญในการดำเนินการ คือพลตำรวจตรีภุชงค์ จุณณวัตต์ เป็นผลให้สามารถออกโฉนดที่ดิน สำหรับราชพัสดุได้ ในปี พ.ศ. 2541สำนักงานตำรวจแห่งชาติ จึงได้จัดสรรงบประมาณให้ดำเนินการก่อสร้าง อาคารที่ทำการสถานีตำรวจนครบาลจักรวรรดิขึ้นใหม่ เป็นอาคารอนกรีตเสริมเหล็กสูง 12 ชั้น แบ่งเป็นอาคารที่ทำการ 2 ชั้น และที่พักอาศัยของข้าราชการตำรวจและครอบครัว จำนวน 10 ชั้น เริ่มดำเนินการก่อสร้างตั้งแต่ พ.ศ.2539 แล้วเสร็จและส่งมอบให้ใช้ในราชการตั้งแต่วันที่ 28 กันยายน พ.ศ. 2544 โดยในส่วนของสถานี มีคณะกรรมการตรวจรับประกอบด้วย